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本刊是由中国航天科工集团公司主管, 由航天科工集团十七所主办。它是仿真技术领域的综合性科技期刊。98年起已列入国家科技部中国科...【详细查看】
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PCA技术在二硫键连接模式预测中的应用研究
【出 处】:《
计算机仿真
》
CSCD
2010年第2期 218-220页,共4页
【作 者】:
裔东亮
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朱林
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杨杰
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沈红斌
【摘 要】
关于二硫键是由蛋白质的两个半胱氨酸之间配对形成的一种共价键,可以存在于同一条蛋白质多肽键内,也可以存在于不同的多肽键之间。二硫键的形成是蛋白质折叠过程中的重要步骤,同时影响蛋白质折叠的速率和途径。因此利用计算机方法预测二硫键连接模式有非常晕要的意义。采用一种新的方法预测二硫键连接模式。结合序列多重特征向量和通过PSIPRED得出的二级结构预测信息。由于原方法会产生高维数据,使用PCA进行降维,在降维后的低维数据上采用支持向量回归技术(SVR)来预测二硫键连接模式。结果显示,上述方法提高了预测精度。